Yayasan Tanratupattanabali didirikan sejak 11 Desember 1995 dengan akta notaris No 17 tanggal 11 Desember 1995 dengan akta perubahan No 17 tanggal 21 Mei 2010 dan telah disahkan sesuai surat keputusan menteri Hukum dan HAM RI No : AHU-2008. AH.01.04. yang didirikan oleh H. Ahmad Taufan dan Hj. Gunasnawati.

Awal mula Yayasan Tanrantupattanabali mendirikan Sekolah Tinggi Ilmu Pertanian 1999, kemudian berkembang atau menambah 1 sekolah tinggi ditahun 2001 yaitu sekolah tinggi Ilmu Sosial dan Ilmu Politik. Karena perkembangan wilayah yang menghendaki lahirnya SDM diberbagai bidang, Yayasan Tanratupattanabali melebur 2 sekolah tinggi menjadi Universitas Tomakaka tahun 2009 dengan 6 Fakultas dan 12 Program Studi.

Diperjalananya Universitas Tomakaka izin untuk menyelenggarakan tambahan 1 Fakultas yaitu Fakultas Syariah dan Ekonomi Islam dengan 2 Program Studi, sehingga sampai saat ini Universitas Tomakaka Yayasan Tanratupattabali selaku penyelenggara Perguruan Tinggi Swasta dan sekolah menengah kejuruan swasta yang dimana salah satu perguruan tingginya adalah Universitas Tomakaka dan Sekolah Menengah Kejujuran yaitu SMK Tanratupattanabali dan SMK Simanangngi.